285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2012 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  72.25 
 
 		 229 aa  333  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  69.74 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  53.42 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  50.67 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  50.22 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  53.09 
 
 		 202 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  45.07 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  45.33 
 
 		 227 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  45.07 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  47.45 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  49.23 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  56.32 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  47.69 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 216 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.24 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  46.5 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  47.13 
 
 		 157 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  34.72 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  43.72 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  42.07 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.22 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.17 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  47.31 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  37.19 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  43.21 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.37 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  49.22 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.46 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  34.85 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  38.01 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.09 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  31.6 
 
 		 492 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  36.59 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  34.94 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.7 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  30.05 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  33.81 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  33.97 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  33.93 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.5 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  30.93 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  34.73 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  30.86 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  33.67 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  33.67 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  34.22 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  32.8 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  34.33 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  30.86 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  30.29 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  30.3 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  36.1 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  38.95 
 
 		 535 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  38.2 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>