284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51454 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  100 
 
 
157 aa  322  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  57.05 
 
 
230 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  54.78 
 
 
213 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  52.87 
 
 
239 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  52.87 
 
 
239 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  52.26 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  52.56 
 
 
233 aa  161  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  51.3 
 
 
227 aa  161  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  50.96 
 
 
221 aa  158  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  51.28 
 
 
231 aa  157  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  49.06 
 
 
232 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  49.04 
 
 
233 aa  151  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  44.38 
 
 
186 aa  151  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  49.07 
 
 
259 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  47.13 
 
 
232 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  46.91 
 
 
244 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  51.25 
 
 
221 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  47.47 
 
 
207 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
228 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  46.58 
 
 
231 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  43.67 
 
 
167 aa  140  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 
212 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  49.37 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  46.95 
 
 
245 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  47.1 
 
 
253 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  45.28 
 
 
240 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
383 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.28 
 
 
224 aa  135  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  45 
 
 
228 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  42.68 
 
 
492 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  45.86 
 
 
213 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  44.87 
 
 
235 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  45.34 
 
 
251 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  45.1 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 
211 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.23 
 
 
365 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.23 
 
 
365 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 
214 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  45.06 
 
 
238 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  45.57 
 
 
228 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 
244 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 
239 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  45.68 
 
 
227 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 
218 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.04 
 
 
237 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  43.95 
 
 
209 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  42.07 
 
 
236 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  40.25 
 
 
228 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 
227 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  41.46 
 
 
235 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  40.24 
 
 
262 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  43.67 
 
 
216 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  40.99 
 
 
209 aa  122  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 
235 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 
229 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 
232 aa  120  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 
234 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.72 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  41.82 
 
 
236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
267 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  39.76 
 
 
241 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  39.05 
 
 
246 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 
223 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 
244 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 
237 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 
207 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
232 aa  117  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 
244 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 
237 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 
243 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  41.36 
 
 
203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 
218 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  36.69 
 
 
216 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.9 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 
212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 
204 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 
270 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  38.41 
 
 
243 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  41.56 
 
 
212 aa  114  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.68 
 
 
246 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  43.29 
 
 
213 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 
216 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 
228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 
232 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  39.77 
 
 
235 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  43.29 
 
 
213 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.14 
 
 
224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  40.82 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  42.18 
 
 
216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  40.36 
 
 
241 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  41.72 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  39.75 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  43.21 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  40.25 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  41.72 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>