285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0397 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  91.2 
 
 		 216 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  91.2 
 
 		 216 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  76.85 
 
 		 214 aa  340  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  43.96 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.26 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.26 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.62 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  38.89 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.7 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 227 aa  158  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.76 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  37.1 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  32.12 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  34.6 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  34.95 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  33.15 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  33.51 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  31.13 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.14 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  32.32 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  40.82 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.7 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  29.25 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  42.21 
 
 		 167 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  29.58 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  30.05 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  32.43 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  31.09 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  31.4 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  31.84 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  31.4 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  31.18 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  32.07 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  28.91 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  31 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  31.15 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  26.7 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.88 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  38.37 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  30.9 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  28.04 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  30.56 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  30.56 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  30.34 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  30.9 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  31.46 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  30.6 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  37.16 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  31.55 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  30.11 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  28.93 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  29.8 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  30 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  32.8 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  29.53 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  31.32 
 
 		 241 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  33.84 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  31.15 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  31.64 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  30.43 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.14 
 
 		 365 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.14 
 
 		 365 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  29.57 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  29.53 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.96 
 
 		 365 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  30.65 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  33.53 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  29.38 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  30.22 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  30.88 
 
 		 247 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  32.75 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  30.48 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  32.02 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  28.79 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  27.14 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  29.38 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  32 
 
 		 383 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>