285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6764 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  50.78 
 
 
214 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  51.05 
 
 
211 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  49.46 
 
 
213 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 
237 aa  167  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 
231 aa  165  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  49.43 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.94 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 
231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 
209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 
240 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 
235 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 
228 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  42.64 
 
 
228 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 
245 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  48.42 
 
 
277 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 
232 aa  158  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
204 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  44.72 
 
 
224 aa  157  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 
259 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.58 
 
 
233 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  46.11 
 
 
228 aa  156  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 
234 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  48.92 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.82 
 
 
233 aa  154  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  44.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 
238 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.45 
 
 
251 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.34 
 
 
244 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  45.12 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  44.95 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  47.95 
 
 
239 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  47.95 
 
 
239 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 
221 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  43.78 
 
 
213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 
207 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.61 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 
228 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 
238 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 
238 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 
238 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  44.56 
 
 
230 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 
212 aa  145  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  42.56 
 
 
218 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.22 
 
 
230 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40.65 
 
 
232 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 
218 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 
246 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  43.85 
 
 
202 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 
213 aa  141  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  41.79 
 
 
218 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 
492 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  46.5 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  40.67 
 
 
218 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.3 
 
 
224 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 
238 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 
213 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  46.5 
 
 
167 aa  136  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 
238 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 
251 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 
215 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 
247 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 
219 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  36.95 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 
218 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  36.95 
 
 
217 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  36.95 
 
 
217 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  40.3 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 
213 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  40.5 
 
 
221 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 
247 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 
236 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 
214 aa  131  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.31 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 
222 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 
227 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  37 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 
365 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 
365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 
365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.64 
 
 
236 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>