284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2933 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  79.83 
 
 		 238 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  73.64 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  73.64 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  73.64 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  71.95 
 
 		 230 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  65.47 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  65.35 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  61.82 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  59.26 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  63.32 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  65.78 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  58.18 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  65.78 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  60.7 
 
 		 221 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  57.51 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  59.22 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  57.99 
 
 		 214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  61.54 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  60.48 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  62.09 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  57.71 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  59.56 
 
 		 214 aa  228  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  59.39 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  57.14 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  57.41 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  61.17 
 
 		 227 aa  221  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  53.68 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  56.57 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  52.11 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  53.59 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  51.24 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  52.26 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  48.83 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.29 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 207 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 535 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.44 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 365 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 365 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  47.37 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.56 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  47.78 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  45.15 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.6 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  43.42 
 
 		 383 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.29 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  44.15 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  42.63 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 211 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 227 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  50.31 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  49.69 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  35.05 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 492 aa  132  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.82 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  36.4 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  42.94 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.24 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  41.52 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  35.82 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  41.58 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>