285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2135 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  62.24 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  58.29 
 
 		 215 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  46.84 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  42.02 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  44.59 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  41.41 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  35.41 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  41.36 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41.25 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  39.16 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.34 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  40.82 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  38.29 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  35 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  34.78 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  32.64 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  36.87 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  41.11 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  37.42 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  41.32 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.53 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36.02 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  40.51 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 383 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  40.51 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1413  lipoate-protein ligase B  37.66 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  37.66 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.42 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  32.81 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  36.6 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  34.83 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.46 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  35.44 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  36.78 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  35.95 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  33.67 
 
 		 268 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  37.17 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.21 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  32 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  32 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2888  lipoate-protein ligase B  32 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  35.1 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  35.93 
 
 		 259 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  30.86 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  33.87 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  32.24 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  37.42 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>