285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2888 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  99.6 
 
 
251 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2888  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  98.41 
 
 
248 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2800  lipoate-protein ligase B  95.62 
 
 
251 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78787  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2938  lipoate-protein ligase B  95.62 
 
 
251 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  95.24 
 
 
252 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  88.45 
 
 
248 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  83.19 
 
 
255 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  78.74 
 
 
254 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
257 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
249 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
249 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
249 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
246 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  84.82 
 
 
252 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  74.38 
 
 
241 aa  341  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  74.79 
 
 
241 aa  340  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  78.38 
 
 
255 aa  334  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  75 
 
 
264 aa  277  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  71.65 
 
 
236 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 
229 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  65.42 
 
 
229 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  64.95 
 
 
229 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  62.37 
 
 
205 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  53.08 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  56.48 
 
 
218 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  53.17 
 
 
220 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  53.14 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  52.2 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  52.15 
 
 
214 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  56.28 
 
 
222 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  54.5 
 
 
219 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  54.59 
 
 
216 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  52.5 
 
 
218 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0400  lipoate-protein ligase B  51.6 
 
 
222 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  52.91 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  52.2 
 
 
216 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  55.25 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  52 
 
 
218 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  51.96 
 
 
219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  54.7 
 
 
217 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  54.5 
 
 
219 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  51.74 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  50.71 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  54.04 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  52.91 
 
 
216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  52.91 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  52.91 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  49.78 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  54.89 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  50.23 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  55.98 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  53.55 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  48.53 
 
 
212 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  50.73 
 
 
213 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  53.04 
 
 
219 aa  208  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  52.15 
 
 
207 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  53.3 
 
 
218 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  51.18 
 
 
216 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  52.43 
 
 
227 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  48.02 
 
 
219 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  55 
 
 
213 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  47.52 
 
 
219 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  52.24 
 
 
236 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  50.46 
 
 
224 aa  205  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  45.96 
 
 
199 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  47.75 
 
 
227 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  52.66 
 
 
218 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  51.81 
 
 
213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  51.81 
 
 
213 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  51.81 
 
 
213 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  51.81 
 
 
213 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  51.81 
 
 
213 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  49.5 
 
 
217 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  49.5 
 
 
217 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  51.93 
 
 
216 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  45.45 
 
 
199 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  48.62 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  46.51 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  48.13 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  47.66 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  47.66 
 
 
232 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  48.29 
 
 
244 aa  198  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  48.54 
 
 
222 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  50.73 
 
 
203 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  49.32 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>