285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  68.33 
 
 
247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  70.18 
 
 
238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 
238 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  65.47 
 
 
238 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 
238 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 
238 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  63.68 
 
 
234 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  61.34 
 
 
247 aa  290  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  66.99 
 
 
213 aa  285  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  65.32 
 
 
230 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  68.88 
 
 
213 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  68.75 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  60 
 
 
251 aa  267  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  62.32 
 
 
225 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  60.1 
 
 
213 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  67.37 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  60.95 
 
 
277 aa  248  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  64.58 
 
 
227 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  63.5 
 
 
236 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  58.77 
 
 
235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  54.39 
 
 
268 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  61.11 
 
 
246 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  61.27 
 
 
214 aa  235  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  56.59 
 
 
214 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  60.31 
 
 
234 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  59.9 
 
 
218 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  58.82 
 
 
244 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  55.43 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  56.22 
 
 
221 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  57.77 
 
 
234 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  55.43 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  54.12 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  55.15 
 
 
232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  52.76 
 
 
252 aa  207  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.52 
 
 
240 aa  177  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  44.78 
 
 
259 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.8 
 
 
251 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.86 
 
 
221 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.22 
 
 
245 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.93 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 
224 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.36 
 
 
240 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 
237 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.53 
 
 
221 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
211 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.96 
 
 
238 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.13 
 
 
213 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.69 
 
 
232 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  41.43 
 
 
209 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 
231 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  44.17 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 
233 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  44.2 
 
 
227 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  35.78 
 
 
232 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.78 
 
 
221 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 
214 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  40 
 
 
213 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.11 
 
 
227 aa  146  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.93 
 
 
233 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
235 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 
212 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 
243 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  45.25 
 
 
239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 
239 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  43.22 
 
 
535 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 
262 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 
228 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  41.06 
 
 
215 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  43.28 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 
212 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.34 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  36.14 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 
383 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 
232 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  45 
 
 
216 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 
244 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.17 
 
 
492 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  44.1 
 
 
236 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  42.35 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  43.62 
 
 
225 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.58 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>