285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2078 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  74.77 
 
 		 218 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  67.43 
 
 		 218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  47.09 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  44.95 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.82 
 
 		 259 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 492 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  37.67 
 
 		 383 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.4 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 365 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 365 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  34.96 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 365 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  35.82 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.63 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.48 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.72 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  37 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.53 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  34.65 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 227 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  36.06 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.23 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  42.41 
 
 		 157 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  35.75 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  35.92 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  38.68 
 
 		 535 aa  122  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  38.92 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  40.23 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  35.96 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  37.95 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  42.55 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  36.16 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  36.16 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  35.65 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  41.13 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  42.55 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  41.13 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  36.93 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  39.76 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  34.81 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  36.05 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  35.83 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  37.71 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  36.75 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.36 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>