285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1756 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  44.65 
 
 
224 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 
259 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 
240 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 
228 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  46.45 
 
 
228 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  42.38 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 
232 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 
232 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  39.26 
 
 
238 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 
231 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  44.6 
 
 
221 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 
240 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  43.64 
 
 
383 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.32 
 
 
244 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  35.59 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.4 
 
 
245 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.36 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 
365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 
365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 
211 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 
492 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  41.05 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  36.45 
 
 
213 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.39 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  41.11 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 
213 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
227 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  42.18 
 
 
216 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  36.06 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  36.45 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  35.1 
 
 
237 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  41.2 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 
239 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  45.68 
 
 
157 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  38.5 
 
 
221 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  34.93 
 
 
209 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  41.62 
 
 
535 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 
236 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 
228 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 
246 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.77 
 
 
241 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 
218 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  36.52 
 
 
262 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  36.94 
 
 
220 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 
212 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 
262 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  41.38 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  42.35 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 
234 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  34.65 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  39.57 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  38.64 
 
 
231 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
232 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 
218 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  39.59 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 
225 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  37.83 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  36.55 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  38.8 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  39.67 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2199  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0165634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  31.09 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2569  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
213 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  37.33 
 
 
237 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 
243 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  37.67 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.21 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 
270 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  39.38 
 
 
236 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 
247 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 
251 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>