285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4305 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  51.42 
 
 
221 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  46.67 
 
 
207 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  46.09 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  51.01 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 
213 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 
259 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.8 
 
 
246 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  41.91 
 
 
235 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  44.88 
 
 
247 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  46.38 
 
 
277 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
237 aa  171  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  46.43 
 
 
365 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  46.8 
 
 
238 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  46.01 
 
 
224 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 
492 aa  169  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
365 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
365 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.87 
 
 
240 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 
221 aa  168  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 
231 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  52.8 
 
 
383 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 
238 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  44.66 
 
 
234 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  40.71 
 
 
244 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 
238 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 
238 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  48.28 
 
 
221 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  40.27 
 
 
228 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 
246 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  40.25 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.97 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 
209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 
251 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  42.23 
 
 
247 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  45.32 
 
 
213 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  42.08 
 
 
225 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  44.32 
 
 
227 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 
213 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 
213 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 
213 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41.96 
 
 
231 aa  158  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 
232 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 
245 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 
218 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  44.51 
 
 
214 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 
232 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 
268 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 
232 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.45 
 
 
212 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.17 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  43.15 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  42.18 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.55 
 
 
535 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 
230 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 
234 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  41.31 
 
 
214 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.31 
 
 
213 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 
228 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.85 
 
 
235 aa  148  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.23 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 
238 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  43.85 
 
 
227 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 
218 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 
234 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 
244 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 
221 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 
212 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 
232 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 
233 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.59 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.76 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  38.46 
 
 
203 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  39.34 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  45.34 
 
 
157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  42.78 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 
237 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  37.67 
 
 
224 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  37.85 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  36.14 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
236 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 
204 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4158  Lipoyl(octanoyl) transferase  38.78 
 
 
225 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  37.84 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 
253 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>