285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4082 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 262 aa  523  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  70.89 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  65.43 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  65.43 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  75.12 
 
 		 236 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  70.97 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  60.76 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 243 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  66.98 
 
 		 220 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  68.98 
 
 		 225 aa  294  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  63.56 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 255 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  71.63 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  71.96 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  64.78 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  65.15 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  72.2 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  62.77 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  69.72 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  63.09 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  65.9 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  76.17 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  67.25 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  68.44 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  64.42 
 
 		 216 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  64.95 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  63.95 
 
 		 231 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  71.5 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.84 
 
 		 226 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  61.16 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  58.18 
 
 		 232 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  50.98 
 
 		 205 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  61.32 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  60.09 
 
 		 218 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  58.71 
 
 		 223 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  62.57 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  58.71 
 
 		 217 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  50.97 
 
 		 214 aa  233  3e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  51.46 
 
 		 214 aa  228  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 209 aa  196  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  46.19 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  43.41 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  41.36 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.38 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  43.08 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  44.62 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 207 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  36.87 
 
 		 199 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 		 215 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 203 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.89 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.64 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  38.17 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.08 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.33 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.08 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  38.36 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  42.2 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  37.37 
 
 		 199 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 227 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 		 365 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.3 
 
 		 202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.59 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  43.03 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  47.06 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>