285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1045 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  75.88 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  76.44 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  76 
 
 		 267 aa  351  7e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  70.51 
 
 		 243 aa  331  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  70.35 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  68.16 
 
 		 237 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  69.27 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  69.01 
 
 		 218 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  71.16 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  60.43 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  67.26 
 
 		 237 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  68 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  69.48 
 
 		 218 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  69.01 
 
 		 218 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  67.76 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  71.7 
 
 		 218 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 225 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 243 aa  296  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  68.14 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  65.93 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  64.13 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  62.77 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  69.41 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  63.23 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.23 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  66.52 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  67.43 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  66.2 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.62 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  67.28 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  61.54 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  66.82 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  64.98 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  58.62 
 
 		 231 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  66.12 
 
 		 211 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  58.85 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.73 
 
 		 228 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  49.07 
 
 		 214 aa  235  6e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  49.54 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  53.81 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  50.91 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  47.89 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  55.24 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.99 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 213 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  45.76 
 
 		 207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  38.53 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.75 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  36.23 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.19 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 227 aa  139  6e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 217 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 217 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.23 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  40.11 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  35.27 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  39.11 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 219 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 215 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>