284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1859 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  67.74 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  61.42 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  61.54 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  59.9 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  60.29 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  59.71 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  59.09 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  61.05 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  60.38 
 
 		 234 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  60.51 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  60.51 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  60.51 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  60.53 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  61.34 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  61.42 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  59.41 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  58.73 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  60.71 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  62.64 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  59.9 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  50.98 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  52.55 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  57.71 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  55.07 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  57.29 
 
 		 277 aa  204  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  56 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  50.93 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  51.87 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  54.12 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  46.61 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  54.55 
 
 		 221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  52.88 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  45.79 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.72 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.82 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.71 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.53 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  44.62 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.62 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.39 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.32 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  38.32 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  45.03 
 
 		 535 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  42.7 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.21 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.21 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.38 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  37.69 
 
 		 492 aa  129  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.06 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  48.8 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.79 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.6 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  45.61 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  46.84 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  44.77 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.3 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  44.2 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.17 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  46.7 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  46.71 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  47.27 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  42.01 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  44.81 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.86 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  46.78 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  43.92 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  43.98 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  43.24 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>