285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1350 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  65.24 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  67.86 
 
 		 222 aa  261  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  61.76 
 
 		 216 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  58.65 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  58.71 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  59.62 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  53.81 
 
 		 246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  58.94 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  52.56 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.07 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  52.09 
 
 		 267 aa  227  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  57.56 
 
 		 236 aa  227  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  60.1 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  56.28 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  53.67 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  59.42 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  55.77 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  55.77 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 241 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  60.61 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  53.37 
 
 		 243 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  57.5 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 		 244 aa  214  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  57 
 
 		 255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  60.2 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  51.42 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  55.39 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  59.8 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  55.4 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  50.47 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  53.33 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  57.22 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  52.97 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  56.16 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  55.24 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  42.52 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  41.59 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  46.8 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  41.09 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.93 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  49.71 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  45.59 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  45.61 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  45.61 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  45.15 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  43.28 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.72 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  39.62 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.01 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  42.48 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  42.48 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 		 227 aa  131  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.94 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  45.4 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  47.22 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  40.7 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  47.22 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  47.22 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  43.55 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  38.12 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  43.45 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 255 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  44.24 
 
 		 383 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  43.55 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.34 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>