285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3560 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  95.26 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  68.88 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  68 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  61.5 
 
 		 213 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  63.29 
 
 		 247 aa  262  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  66.32 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  61.14 
 
 		 225 aa  257  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  65.5 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  58.53 
 
 		 246 aa  254  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  64.43 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  65.78 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  63.5 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  65.45 
 
 		 230 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  64.06 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  63.16 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  51.6 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  62.11 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  63.86 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  61.58 
 
 		 277 aa  238  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  61.22 
 
 		 227 aa  236  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  60.8 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  60.5 
 
 		 214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  59.39 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  57.42 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  60.53 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  58.02 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  53.96 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  56.28 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  54.73 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  55 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  52.79 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  45.83 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.48 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.83 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.77 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  46.57 
 
 		 535 aa  150  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.64 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  42.58 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.25 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.54 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.03 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  45.36 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.22 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  43.65 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 492 aa  141  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  41.3 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.3 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  46.19 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  44.68 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  40.98 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  40.85 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.75 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  44.19 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  48.43 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 383 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 232 aa  127  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 262 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  40 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  38.3 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  43.02 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  43.26 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.58 
 
 		 230 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 365 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 365 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  41.29 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.58 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  45.51 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 262 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>