284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2034 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
244 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  63.9 
 
 
214 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  59.31 
 
 
246 aa  237  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  62.94 
 
 
227 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  59.62 
 
 
213 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  58.57 
 
 
213 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  61.46 
 
 
238 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 
213 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  57.87 
 
 
238 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  57.21 
 
 
234 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  55.56 
 
 
247 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  55.05 
 
 
221 aa  225  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  57.21 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  59.05 
 
 
235 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  57.92 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  57.92 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  57.92 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  61.06 
 
 
218 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  59.41 
 
 
230 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  50.82 
 
 
268 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  57.08 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  56.37 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  53.39 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 
232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  56.46 
 
 
246 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  59.59 
 
 
214 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  52.66 
 
 
213 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  53.57 
 
 
234 aa  202  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  57 
 
 
277 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  57.14 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  50.22 
 
 
233 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  47.91 
 
 
222 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  46.98 
 
 
222 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  48.13 
 
 
251 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  53.47 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  42.23 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  45.75 
 
 
221 aa  151  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.03 
 
 
240 aa  148  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 
251 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.53 
 
 
231 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.76 
 
 
244 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  42.99 
 
 
222 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.71 
 
 
535 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 
232 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 
245 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  38.84 
 
 
492 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.4 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.33 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  38.89 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.75 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 
237 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.48 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 
228 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 
211 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 
212 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  37.05 
 
 
213 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 
239 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  35.89 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 
267 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  34.31 
 
 
244 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.27 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  35.61 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  40.97 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  42 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  42.22 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.5 
 
 
365 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 
214 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  31.42 
 
 
214 aa  116  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.5 
 
 
365 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 
218 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  38.57 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  34.2 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  37.5 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  37.84 
 
 
262 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  36.54 
 
 
232 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 
218 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 
365 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  34.2 
 
 
239 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  36.02 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  41.8 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  34.26 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>