285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0368 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  77.49 
 
 		 215 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  62.24 
 
 		 221 aa  237  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  45.32 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  43.16 
 
 		 277 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  42.62 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  43.65 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  39.39 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.62 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 247 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  38.95 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  35.75 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  41.99 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  34.36 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  38.19 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1413  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  35.45 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  41.07 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  38.58 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  34.36 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  34.29 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  37.32 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  35.38 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  36.02 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  40 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  41.14 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  34.04 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  41.4 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  35.38 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  43.55 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  34.36 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  35 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>