286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1043 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  71.3 
 
 		 221 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  49.3 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  43 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 259 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  40.43 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  43.17 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  42.73 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  42.48 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  43.87 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  45.95 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  43.36 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  43.06 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  43.29 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  45.41 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.2 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  42.6 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.79 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  43.26 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 492 aa  146  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  44.61 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  42.58 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  45.56 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  44.61 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 277 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.99 
 
 		 365 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  44.72 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  35.37 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  46.82 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  40.47 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  45.05 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  42.79 
 
 		 535 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  35.35 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  43.4 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  42.39 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 218 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.79 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  37.44 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  35.98 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  37.8 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>