285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2641 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  71.62 
 
 
221 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  62.39 
 
 
234 aa  275  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  61.76 
 
 
236 aa  271  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  60.55 
 
 
246 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  62.26 
 
 
213 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  62.32 
 
 
246 aa  262  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  62.32 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  64.47 
 
 
221 aa  259  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  64.22 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  61.14 
 
 
213 aa  257  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  63.32 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  63.45 
 
 
227 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  61.73 
 
 
214 aa  248  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  61.84 
 
 
238 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  61.84 
 
 
238 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  61.84 
 
 
238 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  49.22 
 
 
268 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  59.52 
 
 
235 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  61.31 
 
 
238 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  60.91 
 
 
247 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  55.17 
 
 
213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  62.62 
 
 
214 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  55.02 
 
 
234 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  60.91 
 
 
230 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  58.25 
 
 
234 aa  234  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  57.35 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 
218 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  58.17 
 
 
277 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  59.39 
 
 
251 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  57.54 
 
 
222 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  56.85 
 
 
233 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  50.23 
 
 
222 aa  214  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  55.39 
 
 
244 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  55.84 
 
 
252 aa  205  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  46.01 
 
 
259 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 
251 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 
207 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 
221 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.23 
 
 
221 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 
240 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.1 
 
 
245 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  46.41 
 
 
227 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  44.75 
 
 
224 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 
237 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.55 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.26 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.98 
 
 
244 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.4 
 
 
221 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.24 
 
 
213 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 
232 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 
209 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  38.11 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 
232 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 
231 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  35.47 
 
 
238 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.32 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 
492 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  37.17 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 
231 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 
383 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.58 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.78 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  43.82 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.53 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 
239 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  43.98 
 
 
365 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.97 
 
 
202 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  43.98 
 
 
365 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 
235 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  41.53 
 
 
228 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.44 
 
 
215 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  39.09 
 
 
535 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 
230 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  38.58 
 
 
212 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 
228 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 
228 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  46.58 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
209 aa  115  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 
237 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.44 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 
244 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  37.55 
 
 
212 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  35.94 
 
 
236 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 
221 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  43.24 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  42.37 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 
204 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  40 
 
 
246 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>