285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3326 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  95.26 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  68.34 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  68.75 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  60.49 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  64.73 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  64.22 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  65.82 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  64.95 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  65.66 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  65.78 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  67.76 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  58.6 
 
 		 246 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  63.13 
 
 		 236 aa  247  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  59.71 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  63.54 
 
 		 247 aa  244  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  62.32 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  62.76 
 
 		 227 aa  241  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  50.8 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  64 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  60.49 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  61.08 
 
 		 214 aa  237  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  59.5 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  60.1 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  61.05 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  57.62 
 
 		 244 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  57.46 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  58.01 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  55.56 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  55.05 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  53.03 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  38.1 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  46 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 251 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  47.85 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.23 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.01 
 
 		 231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  45.59 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 		 237 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 492 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  46.73 
 
 		 535 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  46.45 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  42.58 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.5 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.03 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  44.69 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 241 aa  137  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.68 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  44.92 
 
 		 227 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  44.2 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  41.71 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.75 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  46.7 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  36.82 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  48.43 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.53 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  43.02 
 
 		 202 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 383 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.17 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  44.89 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  40.61 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  46.01 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.1 
 
 		 365 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.1 
 
 		 365 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  43.85 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.58 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.21 
 
 		 365 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  43.32 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  46.67 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  46.95 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>