284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1480 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  63.3 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  60.71 
 
 		 218 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  60.53 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  55.5 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  55.1 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  52.76 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  52.94 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  55.84 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  54.08 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  51.89 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  53.4 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  51.76 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  53.03 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  52.79 
 
 		 213 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  51.74 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  52.26 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  51.35 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  51.3 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  51.38 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  45.61 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  49.75 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  54.4 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  49.25 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  50.25 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  48.96 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  53.12 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  49.5 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  46.11 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.4 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  35.81 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.68 
 
 		 492 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.11 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  36.74 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  32.22 
 
 		 238 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.09 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  35.42 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  31.28 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  42.31 
 
 		 535 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  36.23 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 212 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  35.05 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  36.1 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  32.76 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  33.19 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  34.82 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  34.05 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  36.63 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  37.77 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  37.16 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  38 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  39.5 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  36.41 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  32.77 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  37.23 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  37.85 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  37.25 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.64 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  34.8 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  34.65 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  36.9 
 
 		 383 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>