285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1675 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  39.82 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.93 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 492 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.8 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  38.24 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  37.32 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.32 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  36.97 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  38.18 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.09 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  33.48 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  38.03 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 383 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  37.25 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.42 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  40.41 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  38.14 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  45.57 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.28 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  36.59 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  37.88 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  35.32 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  32.5 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  38.51 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 227 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  39.47 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  39.78 
 
 		 202 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  40.56 
 
 		 262 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.61 
 
 		 535 aa  121  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  38.28 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.3 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>