285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1741 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  50.68 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  46.93 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  45.12 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  38.18 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  43.3 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  34.4 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  39.82 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  41.84 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  38.22 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.52 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  34.35 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.45 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.58 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.39 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.36 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  34.65 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  37.32 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  33.91 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  35 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 		 492 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 383 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 365 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 365 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.42 
 
 		 365 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  33.04 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  34.55 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  35.9 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  37.81 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  36.54 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  35.19 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  36.02 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  35.53 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  36.8 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 		 227 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  35.02 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  35.23 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  35.42 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  34.56 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4158  Lipoyl(octanoyl) transferase  41.03 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  36.9 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.7 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  34.2 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  39.46 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  33.16 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  33.04 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  35 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  34.17 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  35.75 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  33.49 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.38 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>