285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0665 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  90.83 
 
 		 218 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  89.91 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  73.24 
 
 		 220 aa  323  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  69.01 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 267 aa  305  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 267 aa  305  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  72.3 
 
 		 216 aa  304  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  73.83 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 243 aa  294  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  67.91 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.79 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 241 aa  286  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  65.73 
 
 		 236 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  67.91 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  64.76 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  63.13 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  64.62 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.44 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  63.85 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  67.91 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 255 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.51 
 
 		 247 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  64.22 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  66.3 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  63.72 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.17 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  64.19 
 
 		 245 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  62.33 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  63.26 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  58.65 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  56.42 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  63.27 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  44.91 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  45.83 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  44.19 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  43.2 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.69 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.23 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.09 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  33.01 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  33.01 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  42.23 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.43 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  36.84 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  33.5 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  38.59 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  34.8 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2199  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0165634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.27 
 
 		 365 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  45.4 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2569  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.27 
 
 		 365 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.27 
 
 		 365 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>