285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2774 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  70.53 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  70.42 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  66.09 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 267 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 267 aa  298  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  68.08 
 
 		 246 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 243 aa  297  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  70.89 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 270 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  67.89 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  68.98 
 
 		 262 aa  294  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  69.34 
 
 		 237 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  65.94 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  67.79 
 
 		 236 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  68.87 
 
 		 237 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  68.49 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  69.52 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  68.12 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  68.12 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  70.28 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  61.5 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  65.87 
 
 		 216 aa  278  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  69.48 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  69.86 
 
 		 247 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  71.75 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  67.14 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  64.62 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  62.96 
 
 		 218 aa  267  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  62.96 
 
 		 218 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  66.98 
 
 		 225 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  71.19 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  65.62 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 241 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  61.08 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  63.72 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  57.55 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  62.74 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  58.9 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  53.37 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  50.96 
 
 		 205 aa  237  9e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  51.43 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  57.08 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  55.77 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.2 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.44 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  36.81 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  36.81 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  35.53 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  36.18 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  44.38 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  42.37 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  36.68 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  40.11 
 
 		 213 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 365 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  35.33 
 
 		 199 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 365 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  41.52 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  35 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>