285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0659 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  72.25 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  67.83 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  56.81 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  54.25 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  54.25 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  44.93 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  49.75 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  49.74 
 
 		 202 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  49.28 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  47.45 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.46 
 
 		 227 aa  185  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 214 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  44.78 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  43.01 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.39 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  44 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  46.95 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  40.11 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 212 aa  128  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.72 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  46.58 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  43.83 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  34.38 
 
 		 240 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.45 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  34.39 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  46.76 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  35.05 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  47.06 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  32.49 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  40.33 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  45.45 
 
 		 157 aa  121  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  35.23 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  36.55 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.49 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  35.41 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  39.34 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  38.04 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  36.81 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  34.5 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  36.31 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  37.99 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  37.97 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  38.37 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  43.14 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  35.45 
 
 		 270 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  33.49 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.55 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  35.9 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  33.84 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  33.84 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  34.12 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  43.36 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  34.71 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  34.12 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>