285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6295 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  90.21 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  75.73 
 
 		 244 aa  348  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  74.9 
 
 		 243 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  74.9 
 
 		 244 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  75.12 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  68.72 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  80.19 
 
 		 211 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  68.66 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  65.62 
 
 		 270 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  67.87 
 
 		 255 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  66.38 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  62.72 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  66.37 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  67.79 
 
 		 225 aa  292  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  65.93 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  66.81 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  68.3 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  64.13 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  66.36 
 
 		 216 aa  288  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  64.89 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 218 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  65.73 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.24 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  63.08 
 
 		 220 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  55.32 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  65.81 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  63.56 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  61.8 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  66.99 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  59.81 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  64.15 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  60.93 
 
 		 225 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  62.91 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  59.02 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  54.47 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  59.15 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  49.52 
 
 		 205 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  57.56 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  48.34 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  46.92 
 
 		 214 aa  224  9e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  55.15 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  42.99 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  46.89 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  42.64 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  44.51 
 
 		 227 aa  141  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  46.39 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  44.63 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  42.39 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 259 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  41.85 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  44.57 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  40.81 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  35.91 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  38.98 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  38.58 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  38.98 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  38.98 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  33.5 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  37.99 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  37.99 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  36.53 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  35.64 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  44.1 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.66 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 		 203 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  35.82 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  32.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  33.66 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  42.31 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  39.69 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>