285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1269 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  65.2 
 
 		 209 aa  278  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  64.76 
 
 		 213 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  59.02 
 
 		 211 aa  254  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  64.91 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  61.27 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  59.8 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  50.78 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  42.47 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.19 
 
 		 227 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  43.33 
 
 		 244 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  42.2 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  44.93 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.63 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.92 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  43.66 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.99 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  42.53 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  46.23 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  48.37 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  44.79 
 
 		 202 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  47.46 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.52 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.2 
 
 		 247 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.18 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  41.41 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  43 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  44.24 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  45.11 
 
 		 383 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  44.38 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  41.43 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 492 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  43.55 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 365 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  42.49 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.43 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  44.21 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  44.07 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  44.6 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  44.39 
 
 		 535 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38.91 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  35.29 
 
 		 246 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  41.79 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  41.79 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  41.79 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  38.58 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.31 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  40.82 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.9 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  37.93 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  37.97 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>