285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0665 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  46.63 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  53.18 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  48.37 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  48.24 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  46.24 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  48.39 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.21 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  45.18 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.98 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.56 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.41 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.73 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 365 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 365 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  34.93 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.62 
 
 		 365 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  43.56 
 
 		 202 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  39.76 
 
 		 167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  41.88 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  40.62 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  42.22 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  38.78 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  42.62 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 244 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  40.56 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  42.22 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 383 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  39.25 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.7 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  39.25 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  36.93 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  36.93 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  36.15 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  42.49 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  35.21 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  39.47 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  44.26 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  36.61 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  36.15 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  36.57 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  45.22 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  40.43 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>