285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1701 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  74.03 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  73.16 
 
 		 233 aa  357  8e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  63.2 
 
 		 231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  63.71 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  60.17 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  57.94 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  60.43 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  56.96 
 
 		 244 aa  267  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  49.33 
 
 		 492 aa  204  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  45.95 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.58 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.78 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.53 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.7 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  44.75 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.17 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  40.17 
 
 		 213 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  42.53 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 227 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.97 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  42.2 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  42.22 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  45.95 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  38.63 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  38.77 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.55 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  43.18 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.09 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 383 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 365 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 365 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 365 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  41.82 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  42.53 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  41.96 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.38 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  51.28 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.77 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  37.44 
 
 		 535 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  40.79 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  47.37 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  38.01 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  38.01 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  37.33 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  34.72 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  35.94 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  37.16 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  33.2 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  37.39 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  36.17 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  36.2 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  37.06 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  41.76 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  37.69 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  34.55 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>