284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7404 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  55.56 
 
 
235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
246 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  53.11 
 
 
221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  49.22 
 
 
225 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  52.59 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  51.6 
 
 
213 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  54.39 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  50.8 
 
 
213 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  50.21 
 
 
227 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  52.16 
 
 
247 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  52.1 
 
 
238 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  48 
 
 
234 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  49.6 
 
 
234 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  52.92 
 
 
214 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  47.2 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  47.22 
 
 
213 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  51.77 
 
 
234 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
238 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  47.45 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  47.45 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  47.45 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  50.83 
 
 
247 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  46.3 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  52 
 
 
230 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  49.37 
 
 
214 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  49.59 
 
 
244 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  48.79 
 
 
277 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  44.03 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  46.61 
 
 
218 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  44.35 
 
 
232 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  46.35 
 
 
251 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  40.71 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  42.49 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 
252 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  38.55 
 
 
259 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 
251 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
221 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  34.29 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  37.29 
 
 
221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  33.46 
 
 
240 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 
224 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  35.95 
 
 
237 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  35.32 
 
 
232 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  33.2 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  35.37 
 
 
240 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  37.92 
 
 
222 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  32.44 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  35.32 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  37.1 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 
227 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  33.05 
 
 
211 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  33.2 
 
 
239 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  32.82 
 
 
228 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  33.2 
 
 
239 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  32.5 
 
 
228 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  34.02 
 
 
221 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
232 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  34.26 
 
 
202 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  29.67 
 
 
244 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  33.47 
 
 
209 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  31.03 
 
 
238 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  34.82 
 
 
235 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 
213 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  31.62 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  31.23 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  36.44 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  31.64 
 
 
492 aa  119  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.93 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.93 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 
365 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  34.29 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  33.74 
 
 
233 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  38.25 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  34.17 
 
 
212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  32.62 
 
 
212 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 
238 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  32.63 
 
 
214 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  30.64 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  31.75 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  37.19 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  34.98 
 
 
383 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
218 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  29.76 
 
 
228 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  33.33 
 
 
535 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  33.33 
 
 
215 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  34.42 
 
 
212 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  29.67 
 
 
228 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  32.34 
 
 
236 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  34.23 
 
 
244 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 
220 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  32.05 
 
 
230 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  35.12 
 
 
243 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  31.69 
 
 
218 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 
218 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  33.67 
 
 
221 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  34.39 
 
 
243 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  30.04 
 
 
226 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>