284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  61.73 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  62.81 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  64.43 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  59.81 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  62.93 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  56.59 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  58.25 
 
 		 246 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  59.41 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  59.39 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  59.56 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  59.42 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  60.29 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  58.05 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  56.4 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  57.48 
 
 		 214 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  59.89 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  63.3 
 
 		 252 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  60.66 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  57.58 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  59.02 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  49.37 
 
 		 268 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  49.51 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  58.54 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  57.89 
 
 		 277 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  51.83 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  51.89 
 
 		 233 aa  206  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  55.98 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  44.51 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 240 aa  154  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  45.08 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.53 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 492 aa  139  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  41.46 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 383 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  37.14 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 365 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  35.82 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.3 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  37.37 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  36.92 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  38.66 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  38.66 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  40.24 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  40.11 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.59 
 
 		 233 aa  117  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  37.89 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.21 
 
 		 535 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  37.11 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  37.25 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  39.08 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  32 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  37.38 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  36.36 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  39.77 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>