285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3712 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 240 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  68.38 
 
 		 231 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  68.6 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  62.76 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  62.82 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  61.28 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  58.47 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  60.43 
 
 		 231 aa  284  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  57.96 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  48.66 
 
 		 492 aa  210  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  44.64 
 
 		 207 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.61 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.29 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.52 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.86 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  44.05 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.56 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.1 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.68 
 
 		 535 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  42.73 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  41.2 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  39.83 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  46.49 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  41.41 
 
 		 227 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  40.65 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.09 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.74 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.19 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.75 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.5 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  38.36 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.27 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 365 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 365 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  37.89 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  37.72 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  43.39 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 227 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  37.67 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  35.02 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  33.46 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  45.11 
 
 		 383 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  45.28 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  36.77 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  34.86 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  36.24 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  34.19 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  34.07 
 
 		 252 aa  138  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  41.21 
 
 		 186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  34.38 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.67 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  41.67 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  35.14 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>