285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2713 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  70.64 
 
 		 218 aa  314  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  67.43 
 
 		 218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  44.93 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.56 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.61 
 
 		 244 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  40.67 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.2 
 
 		 535 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  34.98 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 245 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  38.25 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  39.77 
 
 		 383 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  34.67 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 		 492 aa  129  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.89 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 		 259 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  37.81 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.58 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.5 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  38.79 
 
 		 240 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  36.41 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  38.78 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  38.2 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  39.61 
 
 		 157 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  39.78 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 277 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  38.25 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  41.24 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  32.26 
 
 		 241 aa  114  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  36.82 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  33.66 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  33.17 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  37.35 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  34.85 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 		 259 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  32.52 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  34.6 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  33.17 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  34.83 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 244 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  37.22 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  35.83 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>