285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1183 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  66.48 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  45.4 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  41.34 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.77 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.1 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 365 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  40.33 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.64 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  36.36 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.58 
 
 		 492 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  40.37 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.55 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  42.01 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  34.57 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  40.99 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  34.67 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  37.19 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  33.94 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  33.77 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  34.04 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  36.96 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  33.63 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  35.61 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  35.09 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  33.47 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.36 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  35.41 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  33.5 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  33.5 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  37.3 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  34.57 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  33.01 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  33.01 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  36.18 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  37.97 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  35.32 
 
 		 255 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  35.38 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  34.86 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  35.35 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  35.64 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  35.35 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  35.35 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>