285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0719 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  94.61 
 
 		 204 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  59.8 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  60.78 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  53.43 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  63.95 
 
 		 227 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  53.92 
 
 		 211 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  48.39 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  45.05 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  48.3 
 
 		 227 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 228 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  42.36 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 245 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.8 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  45.4 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.93 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  51.68 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 247 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.75 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  46.11 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 237 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.65 
 
 		 233 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  44.72 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  40.7 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  42.38 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 251 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  47.09 
 
 		 277 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  44.38 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 246 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.27 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  38.66 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  37.8 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 492 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  39.22 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  42.01 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  48.92 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  41.84 
 
 		 535 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  39.16 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  44.17 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  36.9 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.82 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  38.29 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 365 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 267 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  40.22 
 
 		 244 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.94 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 267 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  34.48 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  43.26 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  38.29 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 365 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>