285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4158 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4158  Lipoyl(octanoyl) transferase  100 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 383 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  38.43 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  37.05 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 365 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  42.69 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.3 
 
 		 492 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  39.9 
 
 		 535 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  41.3 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  37.19 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.27 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.15 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  37 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  34.78 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  32.54 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  35.07 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  31.2 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  37.75 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  35.91 
 
 		 238 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  34.67 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  35.08 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  32.28 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  28.63 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  35.94 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  33.93 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  36.91 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  33.49 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  36 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  37.35 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  32.06 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  29.21 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  31.82 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  32.8 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  31.77 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  31.75 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  36.81 
 
 		 157 aa  86.3  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  35.87 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  32.8 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.51 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  31.75 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  34.64 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  33.48 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  32.95 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  34.76 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  29.61 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  36.53 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  37.1 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  34.44 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  39.19 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  33.51 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  34.84 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  30.69 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01190  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  34.02 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  35.6 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  37.84 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  37.89 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  39.87 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  35.29 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  36.51 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  33.71 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  37.75 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  32.22 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>