285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51519 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  48.21 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  50.66 
 
 		 253 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 235 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  48.68 
 
 		 230 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  47.34 
 
 		 239 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  47.34 
 
 		 239 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 232 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  43.45 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.41 
 
 		 227 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  45 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  47.06 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  43.67 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 244 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 239 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 212 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  42.77 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  46.95 
 
 		 229 aa  134  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 231 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  39.76 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.71 
 
 		 231 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  45.64 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.15 
 
 		 233 aa  124  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 227 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 207 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  45.73 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 		 245 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  42.76 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.9 
 
 		 244 aa  121  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.59 
 
 		 214 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  39.47 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  42.17 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.68 
 
 		 224 aa  118  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  40.85 
 
 		 236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 		 216 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 216 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  41.51 
 
 		 217 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 365 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 365 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 243 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  42.24 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 259 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 365 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 235 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  38.41 
 
 		 244 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 262 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  38.41 
 
 		 244 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  44.29 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 383 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  41.14 
 
 		 207 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  43.66 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 		 241 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  39.05 
 
 		 216 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  39.24 
 
 		 212 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  41.61 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.76 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  43.15 
 
 		 240 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 226 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  42.47 
 
 		 222 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 244 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  39.74 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.57 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 262 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.51 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  42.47 
 
 		 245 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  37.66 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 		 219 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  37.65 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  36.53 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 239 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  39.38 
 
 		 214 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 226 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.59 
 
 		 246 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  39.38 
 
 		 228 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  37.42 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  44.7 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 217 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>