285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1736 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  97.49 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  56.17 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  53.78 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  50.67 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  54.25 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  44.76 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  47.06 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  46.57 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  45.67 
 
 		 227 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  45.69 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 216 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  43.88 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.47 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  42.65 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  41.4 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  45.16 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  42.48 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  38.15 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  36.68 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  41.18 
 
 		 157 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  34.98 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  33.49 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  35.32 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  33.5 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  32.06 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  44.53 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  32.38 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  35.91 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 213 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  37.27 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  29.06 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  33.17 
 
 		 492 aa  118  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  34.78 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  37.42 
 
 		 383 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  34.21 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  35.61 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  31.78 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  33.66 
 
 		 262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  41.51 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  31.78 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  29.74 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.33 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36.57 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  43.8 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  40.25 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.79 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  43.07 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  35.8 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.24 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  35.16 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  32.21 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  35.79 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.97 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  35.08 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  34.3 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  35.08 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  35.08 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  36.63 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  30.95 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  34.08 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  34.69 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  34.62 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>