285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0185 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  99.13 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  93.89 
 
 		 229 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  66.05 
 
 		 255 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  69.34 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  67.84 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  67.89 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  67.12 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  65.89 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  66.97 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  65.89 
 
 		 251 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  65.42 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  65.89 
 
 		 248 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2800  lipoate-protein ligase B  63.35 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2938  lipoate-protein ligase B  63.35 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2888  lipoate-protein ligase B  65.42 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  54.72 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  55.56 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  63.07 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  55.37 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  49.78 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  58.05 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  62.77 
 
 		 222 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  51.89 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  48.89 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  52.36 
 
 		 218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0400  lipoate-protein ligase B  49.32 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  53.19 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  57.71 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  47.77 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  53.01 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  57.06 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  54.55 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  47.32 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  51.63 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  51.63 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  51.63 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  51.63 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  48.03 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  51.63 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  55.15 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  52.15 
 
 		 224 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  51.66 
 
 		 216 aa  205  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  50.26 
 
 		 216 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  51.12 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  51.98 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  53.18 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  51.98 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  49.03 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  49.76 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  51.98 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1264  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0529911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  57.93 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  54.34 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0471  lipoate-protein ligase B  53.2 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  53.57 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  51.12 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  50.82 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  53.3 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  52.57 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  52.17 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  54.97 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0314  lipoate-protein ligase B  44.73 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  54.34 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0363  lipoate-protein ligase B  47.41 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  50.27 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  49.46 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  50.27 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  50.27 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  54.29 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  53.71 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  51.43 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  48.55 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0411  lipoate-protein ligase B  46.67 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  53.93 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  52 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  53.14 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  51.98 
 
 		 207 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  47.98 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  52.87 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  51.96 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>