96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1549 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  61.11 
 
 
214 aa  254  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  63.35 
 
 
209 aa  249  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  56.99 
 
 
193 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  59.47 
 
 
202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 
366 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  61.78 
 
 
192 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  62.03 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  57.58 
 
 
172 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  54.5 
 
 
195 aa  184  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  53.14 
 
 
215 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  52.57 
 
 
215 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  52.57 
 
 
215 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  52.57 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  53.49 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  53.49 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  43.68 
 
 
204 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  45.14 
 
 
199 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  39.13 
 
 
204 aa  134  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  47.78 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  39.47 
 
 
200 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  35.12 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  36.56 
 
 
200 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
515 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 
631 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 
308 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
492 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  25.55 
 
 
634 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  35.87 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.27 
 
 
484 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  30.26 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  30.26 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  30.26 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  27.98 
 
 
632 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  26.8 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  28.47 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  28.93 
 
 
634 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  26.14 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  28.93 
 
 
634 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  25.81 
 
 
280 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  32.22 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  30.66 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  26.8 
 
 
223 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  38.71 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  25.71 
 
 
485 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.75 
 
 
515 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  27.14 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  27.85 
 
 
641 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.11 
 
 
515 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  28.1 
 
 
300 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  27.4 
 
 
571 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 
685 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  30.1 
 
 
685 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  28.15 
 
 
743 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  30.85 
 
 
231 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.58 
 
 
288 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
1116 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  26.67 
 
 
638 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
639 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  28.79 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  25.95 
 
 
392 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  28.42 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  30.26 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  31.4 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  26.96 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  29.2 
 
 
792 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  29.03 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  27.59 
 
 
667 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  32.22 
 
 
1117 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  31.25 
 
 
279 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  28.03 
 
 
278 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  30.34 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 
1128 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  28.48 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  25.83 
 
 
391 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  32.31 
 
 
1155 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  25.83 
 
 
391 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
689 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
311 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  40.79 
 
 
616 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 
326 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 
310 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  27.7 
 
 
236 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
267 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  26.06 
 
 
638 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
914 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  28.43 
 
 
886 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 
273 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
290 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  29.03 
 
 
285 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>