62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1835 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  76.82 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  76.58 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  43.84 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  45.54 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  43.26 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  44.05 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  46.39 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  45.63 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  44.76 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  46.43 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  41.04 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  42.51 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  42.51 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  42.51 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  44.08 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  35.2 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  46.15 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  31.63 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.51 
 
 		 1305 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  28.4 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.97 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  30.77 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  29.5 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.01 
 
 		 392 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 		 515 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 366 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 		 515 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  37.5 
 
 		 515 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  27.89 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 492 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  27.46 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 478 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  29.37 
 
 		 485 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 510 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 743 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  31.36 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  22.88 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 		 737 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 685 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 846 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 794 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  27.94 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  22.88 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  34.41 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 		 634 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  21.97 
 
 		 391 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  21.97 
 
 		 391 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 		 528 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.87 
 
 		 827 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 		 790 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>