46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2335 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  423  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  44.79 
 
 
204 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  43.78 
 
 
193 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  43.78 
 
 
211 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 
209 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  43.89 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  42.47 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  44.09 
 
 
202 aa  144  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  40.22 
 
 
216 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  42.29 
 
 
214 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  39.13 
 
 
202 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  42.14 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  36.6 
 
 
366 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  40.21 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  41.34 
 
 
195 aa  121  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  34.76 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  41.3 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  34.22 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  34.22 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  35.56 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  35.56 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  34.22 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  35.87 
 
 
200 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  35.56 
 
 
234 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  26.9 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  28.89 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  23.53 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  29.35 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  33.85 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  31.11 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  33.85 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  24.65 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  26.06 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  24.29 
 
 
314 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  29.7 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  26.53 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  26.21 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  27.47 
 
 
485 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  32.29 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  26.09 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  42.5 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 
1225 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 
272 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  26.71 
 
 
278 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  35.56 
 
 
237 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
269 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>