51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3634 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  467  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  48.73 
 
 
204 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  50 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  53.37 
 
 
234 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  50.74 
 
 
217 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  50.74 
 
 
217 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  50.74 
 
 
217 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  47.66 
 
 
220 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  46.6 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  46.73 
 
 
223 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  47.98 
 
 
235 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  49.51 
 
 
220 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  42.79 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  47.83 
 
 
239 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  46.43 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  46.43 
 
 
236 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  46.5 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  32.47 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  38.04 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  30.99 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  33.06 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  26.5 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  28.68 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  34.35 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 
492 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  27.34 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  31.93 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  35.87 
 
 
192 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
232 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
281 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  31.33 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  30.95 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.95 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 
661 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
662 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  31.65 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  29.94 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.89 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  29.94 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  29.29 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  33 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  33 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.01 
 
 
1305 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  29.79 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  26.54 
 
 
272 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 
822 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  31.73 
 
 
211 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.47 
 
 
273 aa  41.6  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>