51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1053 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  62.3 
 
 
214 aa  248  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  60.21 
 
 
193 aa  247  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  60 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  60.53 
 
 
202 aa  239  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  61.78 
 
 
202 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
366 aa  207  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  52.63 
 
 
211 aa  201  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  57.53 
 
 
195 aa  192  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  56.96 
 
 
172 aa  190  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  48.59 
 
 
215 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  48.59 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  48.59 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  48.59 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  48.59 
 
 
215 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  48.59 
 
 
228 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  43.89 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  40.62 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  39.25 
 
 
200 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  40.57 
 
 
199 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  41.8 
 
 
200 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  36.26 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  27.33 
 
 
242 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  29.53 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  35.66 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  30.41 
 
 
235 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  28.08 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  28.24 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
236 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  29.55 
 
 
223 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  29.45 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  29.45 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  29.45 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
571 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  30.23 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  35.87 
 
 
225 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  25.5 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  30.26 
 
 
234 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  23.13 
 
 
280 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  39.33 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  28.41 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  30.11 
 
 
453 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  28.12 
 
 
485 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  27.41 
 
 
898 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  37.93 
 
 
840 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
631 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  24.83 
 
 
343 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  37.5 
 
 
239 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>