53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0446 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  67.37 
 
 
202 aa  281  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  60.21 
 
 
192 aa  247  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  56.99 
 
 
202 aa  247  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  58.55 
 
 
214 aa  246  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  59.47 
 
 
209 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
366 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  50.53 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  60 
 
 
172 aa  209  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  56.91 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  47.7 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  47.13 
 
 
215 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  47.13 
 
 
215 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  47.95 
 
 
215 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  47.95 
 
 
228 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  47.13 
 
 
215 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  43.78 
 
 
204 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  41.15 
 
 
204 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  42.53 
 
 
199 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  41.27 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  38.38 
 
 
216 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  40.86 
 
 
200 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  40.66 
 
 
203 aa  111  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  29.66 
 
 
242 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  24.31 
 
 
634 aa  54.7  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  29.31 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  26.71 
 
 
631 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  33.06 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  31.06 
 
 
220 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  31.71 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  32.31 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  25.37 
 
 
280 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 
492 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  24.67 
 
 
571 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 
282 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  27.63 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  27.63 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  27.63 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  31.54 
 
 
310 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  27.13 
 
 
244 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  26.27 
 
 
272 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 
485 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  27.36 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
236 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 
525 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
274 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 
515 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  25.89 
 
 
453 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>