50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3713 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  100 
 
 		 214 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  61.11 
 
 		 202 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  62.3 
 
 		 192 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  62.3 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  58.55 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  59.39 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  55.79 
 
 		 366 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  53.68 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  57.32 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  52.13 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  45.2 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  45.2 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  45.2 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  45.2 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  45.93 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  45.93 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  44.51 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  42.93 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  42.29 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  39.15 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  44.62 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  36.08 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  43.01 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  30.28 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  34.83 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  28.87 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  28.17 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  27.46 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  30.85 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  27.97 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  27.97 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  27.97 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  27.46 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  26.56 
 
 		 656 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  23.65 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  26.43 
 
 		 631 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  29.58 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  34.41 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 478 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  26.19 
 
 		 292 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.85 
 
 		 515 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.85 
 
 		 515 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 485 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  25.62 
 
 		 635 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  25.79 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>