56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1055 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  65.5 
 
 
200 aa  271  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  42.93 
 
 
214 aa  154  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  41.27 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  40.21 
 
 
209 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  40.21 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  41.8 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  41.58 
 
 
202 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  39.47 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  34.55 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  37.37 
 
 
211 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  37.79 
 
 
199 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  41.38 
 
 
215 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  41.38 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  41.38 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  41.38 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  40.8 
 
 
215 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  40.8 
 
 
228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  39.89 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  41.11 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  32.43 
 
 
216 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  36.77 
 
 
172 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  30.82 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
234 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  34.06 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  31.06 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  32.59 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
492 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  30.37 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  28.36 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  27.71 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  24.39 
 
 
485 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  29.2 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  25.44 
 
 
484 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  26.19 
 
 
525 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  27.07 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 
343 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  27.07 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  24.06 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  29.52 
 
 
659 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  29.63 
 
 
220 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 
279 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  34.92 
 
 
515 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 
272 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  31.45 
 
 
495 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  30.16 
 
 
232 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  29.79 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>