23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1334 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  487  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  80.85 
 
 
237 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  58.19 
 
 
237 aa  301  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  58.97 
 
 
244 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  58.52 
 
 
234 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  50.88 
 
 
232 aa  250  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  56.79 
 
 
187 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  56.79 
 
 
187 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4868  hypothetical protein  26.9 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0256535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 
822 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38235  predicted protein  25.93 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  32.62 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  27.86 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  32.84 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  29.03 
 
 
1155 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  27.36 
 
 
343 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  29.81 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0758  putative lipoprotein  23.85 
 
 
718 aa  42.7  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  34.83 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  27.01 
 
 
515 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
282 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  27.7 
 
 
202 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>